• PCR — reakcja łańcuchowa polimerazy

    Cykle denaturacji, przyłączania starterów i wydłużania selektywnie amplifikują wskazany fragment DNA; produkt wykrywa się końcowo lub w czasie rzeczywistym. Rola: wykrywanie określonej sekwencji DNA.

  • qPCR i RT-qPCR

    Fluorescencja śledzi narastanie produktu w każdym cyklu; dla RNA etap odwrotnej transkrypcji tworzy komplementarny DNA. Rola: czułe wykrywanie i orientacyjne oznaczenie DNA lub RNA.

  • Cyfrowy PCR (dPCR)

    Próbkę dzieli się na tysiące reakcji, klasyfikuje partycje jako dodatnie lub ujemne i oblicza liczbę kopii z rozkładu Poissona. Rola: bezwzorcowe oznaczenie liczby kopii sekwencji.

  • Amplifikacja izotermiczna LAMP

    Zestaw kilku starterów amplifikuje cel w stałej temperaturze, a produkt można wykrywać fluorescencyjnie, turbidymetrycznie lub barwnie. Rola: szybki ukierunkowany przesiew molekularny.

  • ELISA

    Swoiste wiązanie antygen–przeciwciało jest przekształcane przez znacznik enzymatyczny w mierzalny sygnał barwny lub fluorescencyjny. Rola: wykrywanie antygenu, toksyny lub przeciwciała.

  • Sekwencjonowanie NGS i metagenomika

    Miliony fragmentów kwasu nukleinowego są odczytywane równolegle, składane lub porównywane z bazami w celu identyfikacji organizmów, wariantów i domieszek. Rola: szeroka identyfikacja i charakterystyka genomowa.

  • Hodowla, mikroskopia i identyfikacja fenotypowa

    Materiał namnaża się w kontrolowanych warunkach, ocenia morfologię, barwienie, cechy metaboliczne i podatność, a wynik zestawia z metodami molekularnymi. Rola: wykazanie żywotności i charakterystyka izolatu.

  • MALDI-TOF MS w identyfikacji mikroorganizmów

    Laser desorbuje i jonizuje materiał osadzony z matrycą, a rozkład mas dominujących białek jest porównywany z biblioteką profili. Rola: identyfikacja izolatu na podstawie profilu białkowego.